Liczne badania wskazują na korzystny wpływ ozonoterapii na przyspieszenie regeneracji tkanek oraz poprawę właściwości fizyko-chemicznych krwi. Ponadto ozon wykazuje silne właściwości antyseptyczne. Z jego pomocą można też modulować odpowiedź immunologiczną organizmu.

Z uwagi na lecznicze właściwości ozonu jest on coraz częściej stosowany w stomatologii jako alternatywa dla tradycyjnego leczenia próchnicy, nadwrażliwości zębiny oraz przebarwień różnego pochodzenia. Szczególnie chętnie wykorzystywany jest w chirurgii stomatologicznej, gdzie służy do odkażania kanałów korzeniowych oraz pola operacyjnego. W ortodoncji i protetyce stomatologicznej stosowany może być jako środek przeznaczony do dezynfekcji aparatów ortodontycznych oraz materiałów protetycznych.

Ozonoterapia polecana jest także przed i po zabiegu implantacji wszczepów śródkostnych — zmniejsza dolegliwości bólowe, a także przyspiesza proces gojenia się ran.