Mimo że istnieje wiele chorób zębów i innych struktur jamy ustnej, do najczęściej występujących należą:

• próchnica zębów – powoduje trwałe ubytki w strukturze zęba, które tworzą się w wyniku działania kwasów bakteryjnych wydzielanych jako produkty przemiany tych drobnoustrojów; kiedy zmiany próchnicowe przejdą przez szkliwo, bakterie mogą zacząć uszkadzać leżącą niżej zębinę;

• pleśniawki – najczęściej powodowane są nadmiarem drożdżaków należących do rodzaju Candida; wydaje się, że kobiety są bardziej podatne na rozwój pleśniawek od mężczyzn;

• nowotwory i stany przednowotworowe – nie każda zmiana jest zmianą rakową, ponieważ w jamie ustnej może również rozwijać się nowotwór nieinwazyjny; zmiany nowotworowe zwykle występują na języku, dziąsłach, wewnętrznej stronie policzka;

• zapalenie dziąseł i przyzębia – to powszechnie występujące choroby, ale nieleczone stają się groźne, gdyż mogą prowadzić nawet do utraty zębów;

• nadwrażliwość zębów – może wystąpić w wyniku zabiegów stomatologicznych bądź po wybielaniu zębów; może również wskazywać na toczące się procesy próchnicowe lub na chorobę dziąseł;

• kserostomia, czyli suchość w jamie ustnej;

• nieprawidłowości w obrębie stawu skroniowo-żuchwowego – mogą wynikać z różnych przyczyn, w tym bruksizmu, urazu, zapalenia stawu, stresu.