Istnieje coraz więcej dowodów wskazujących na związek między zdrowiem jamy ustnej a zakażeniem Helicobacter pylori w przewodzie pokarmowym człowieka. Z badań wynika, że ta groźna dla zdrowia człowieka bakteria bytuje w różnych strukturach jamy ustnej, w tym w płytce nazębnej, kieszonkach dziąsłowych, ślinie i migdałkach. Przetrwanie bakterii w jamie ustnej może prowadzić do ponownych infekcji przewodu pokarmowego po skutecznym usunięciu patogenu z żołądka.

Uważa się też, że osoby z chorobami przyzębia mają wyższe ryzyko nosicielstwa H. pylori w jamie ustnej, a bakterie kolonizujące pogłębione kieszonki dziąsłowe mogą ułatwiać przetrwanie tego drobnoustroju w jamie ustnej. Niektóre badania sugerują też, że skuteczna higiena jamy ustnej i leczenie chorób przyzębia mogą zmniejszyć częstość występowania zakażenia H. pylori w przewodzie pokarmowym. Jest to spostrzeżenie ważne w kontekście tego, że stan zapalny jamy ustnej może zwiększać podatność na zakażenie tą bakterią poprzez osłabienie bariery odpornościowej. Dobra higiena jamy ustnej może zatem wspierać leczenie zakażeń przewodu pokarmowego H. pylori.