Korzystne bakterie probiotyczne jako jedne z pierwszych kolonizują jamę ustną – przekazywane są wraz z mlekiem matki. 

Istnieje wiele dowodów na to, że bakterie probiotyczne wywierają pozytywny wpływ nie tylko na funkcjonowanie układu pokarmowego, ale również na zdrowie jamy ustnej. Obecnie wiemy, że probiotyki mogą korzystnie działać zarówno w leczeniu chorób jamy ustnej, jak i w zapobieganiu im. Wyniki ostatnich badań wskazują, że bakterie te aktywnie zmniejszają objawy próchnicy, zapalenia dziąseł i przyzębia oraz kłopotliwy symptom nieświeżego oddechu. Odkryto, że bakterie probiotyczne wzmacniają odpowiedź odpornościową u swojego gospodarza, a także zmniejszają produkcję czynników działających prozapalnie. Obecnie prowadzone są liczne badania nad możliwym wykorzystaniem bakterii probiotycznych w leczeniu na szeroką skalę problemów zdrowotnych przyzębia. 

Probiotyki mogą również pomagać chronić zęby przed próchnicą. Potrafią ograniczać przyleganie drobnoustrojów do powierzchni zęba, a tym samym wpływają na zmniejszenie występowania uszkodzeń szkliwa przez hamowanie rozwoju mikrobiomu płytki nazębnej.

Korzyści z zastosowania probiotyków odnoszą również palacze, u których ryzyko wystąpienia chorób przyzębia jest szczególnie wysokie. Wyniki jednego z badań ujawniły, że palacze, którzy otrzymywali bakterie probiotyczne, mieli lepsze wartości po sondowaniu głębokości kieszonek dziąsłowych i wskaźnika płytki nazębnej w stosunku do grupy kontrolnej z placebo.