Infekcje wirusowe mogą manifestować się w postaci zmian zapalnych w obrębie śluzówki jamy ustnej. Nieprawidłowości wynikające z zakażenia wirusem mogą dotyczyć tylko fragmentów błony śluzowej jamy ustnej bądź być widoczne na całej śluzówce, także tej części, która pokrywa dziąsła i język. Zmiany powinien obejrzeć stomatolog.

Najczęstsze zakażenia wirusowe, które mogą dawać zmiany w jamie ustnej, to:

• opryszczkowe zapalenie jamy ustnej – potocznie zwane jako opryszczka, powodowane przez wirus Herpes simplex; zmiany lokalizują się na błonach śluzowych jamy ustnej i warg, a czasem także na skórze twarzy; wykwity pojawiają się bardzo szybko, po krótkotrwałym okresie swędzenia, i szybko też przekształcają się z pęcherzy wypełnionych surowiczą treścią w wykwity z ropną zawartością, a następnie pokrywają się strupami;

• ospa wietrzna – wywołana wirusem Varicella zoster – może powodować na śluzówce jamy ustnej, głównie na podniebieniu, wykwity podobne do tych, które pojawiają się na skórze;

• odra – charakterystyczne jest zaczerwienienie błony śluzowej policzków na wysokości dolnych zębów trzonowych z białymi wykwitami – są to plamki Koplika;

• pryszczyca – jama ustna jest obszarem najczęstszej manifestacji zakażenia; w miejscu początkowo zmienionym zapalnie pojawiają się charakterystyczne pęcherze o surowiczo – ropnej treści;

• wirus HIV – najwcześniej zakażenie manifestuje się grzybicą jamy ustnej, co świadczy o spadku odporności, mogą temu towarzyszyć zmiany opryszczkowe i owrzodzenia; z czasem pojawia się leukoplakia włochata, a następnie mięsak Kaposiego – nowotwór złośliwy.